As empresas e instituições de ensino interessados em participar do Programa devem se cadastrar. As empresas irão nesse momento informar qual o problema que gostariam de resolver. Um professor e um estudante de uma instituição de ensino entram então em contato com a empresa para formular um projeto que tenha o potencial de solucionar as necessidades relatadas pela empresa. Esse projeto é então submetido à analise e julgamento de uma Comissão Técnica. Os projetos aprovados terão um período de seis meses para a realização na empresa, por um bolsista orientado por um professor, das atividades previstas no projeto. Os melhores projetos serão premiados estadualmente e encaminhados a uma comissão julgadora nacional que escolherá e premiará os melhores projetos nacionalmente.

Os projetos a serem desenvolvidos nas MPEs em 2008 e 2009, deverão contemplar os temas de Inovação, Empreendedorismo, Tecnologia e Gestão. Os temas devem abranger as seguintes áreas:

• Gestão Tecnológica
• Engenharia
• Controle e Processos Industriais
• Gestão Ambiental
• Biotecnologia
• Nanotecnologia
• Energias Renováveis e Eficiência energética
• Logística
• Produção de Design
• Agronegócios
• Produção Alimentícia
• Informação e Comunicação
• Saúde e Segurança do Trabalho

Os projetos devem visar à criação e ao aperfeiçoamento de PRODUTOS, PROCESSOS e/ ou SERVIÇOS da empresa participante.